Opa, POG é demais XD!
Sua solução é interessante! Resolvi essa questão das variáveis de ambiente com as funções System.setProperty() e System.getProperty(). Entretanto, só é possível manipular variáveis criadas pelo programa. Variáveis de ambiente "nativas", tipo LD_LIBRARY_PATH, não são alteradas (ou mesmo recuperadas, no caso do get).
Obrigado pela ajuda, pessoal! o/
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